Для эффективного использования функции аварийного восстановления с носителей CD, DVD и USB необходимо загрузить компьютер с соответствующего носителя. Порядок загрузки настраивается в параметрах BIOS. Кроме того, на этапе запуска компьютера можно вызвать меню загрузки; обычно оно вызывается с помощью клавиш F9—F12, в зависимости от версии системной платы и BIOS.
После загрузки запускается ESS или ENA. Поскольку средство ESET SysRescue используется лишь в особых случаях, некоторые модули защиты и функции ESS и ENA не требуются и их список сужен до функций сканирования компьютера, обновления и некоторых разделов настроек. Возможность обновления базы данных сигнатур вирусов является наиболее важной функцией ESET SysRescue. Перед началом сканирования компьютера рекомендуется обновить программу.