После того как клиент переместил зараженный файл в карантин, вирус или угроза не может заразить другие файлы на локальном компьютере или по сети. Однако угроза не удаляется из файла в карантине. Она остается на компьютере до тех пор, пока клиент не удалит угрозу или весь файл. У пользователя отсутствует доступ к этому файлу, но он может его удалить из карантина.

После обновления описаний вирусов на компьютере клиент автоматически проверяет файлы в карантине. Файлы в карантине можно просканировать повторно. В некоторых случаях файлы из карантина удается исправить.

Большинство вирусов можно поместить в карантин. Загрузочные вирусы, как правило, заражают загрузочный сектор или таблицу разделов, а эти элементы переместить в карантин нельзя. Иногда клиент обнаруживает неизвестный вирус, который не удается исправить с помощью текущего набора описаний вирусов. Если пользователь считает, что какой-либо файл заражен, но при сканировании ничего не обнаруживается, такой файл следует поместить в карантин вручную.